电脑插个“U盘”就能给基因测序：实时查看结果，售价1000美元

现在，你也可以像黑客帝国里的 Neo 一样，查看构成自己和别人的源代码了。

方法也非常简单，将体液滴到这样一个大号的U 盘上:

然后连线插进电脑，再配合软件使用，就能近乎实时地查看你的 DNA 测序结果了:

毕竟现实中的我们并不生活在矩阵里，也不是由代码组成。

但作为人体生长发育配方的 DNA 序列，某种程度上就相当于一个人的源代码了。

而理论上，上述的这一方法甚至能在 6 小时内对超过 1.6 亿个碱基进行测序，速度非常快。

这是怎么做到的。

从把 DNA拉丝并推进一个纳米尺寸大小的孔洞里开始:

将 DNA拉丝进洞

这是一种叫做纳米孔测序的技术。

在这种方法里，未知序列的样品会被输送穿过一个直径 1 纳米的小孔。

以人类体液为样本，需要先利用酶拉开DNA 分子的拉链，让一根单链进入纳米孔:

纳米孔所在的生物系统会泡在电解质溶液中，并被施以空间匀强电场。

DNA 在核酸外切酶的作用下被迅速逐一切割成单个碱基分子，在电场的驱使下通过纳米孔，此时，就会形成可检测的离子电流。

不同碱基的化学性质不同，这也就使得整条 DNA 链会在穿越纳米孔引起幅度不同的电流变化。

而这种电流信号的强弱，就能反映 DNA 样本的核酸序列信息。

具体而言，每一个 DNA 片段都就会返回一个基于核苷酸变化的电压读数。

当然，这种反映并不直观，还需要通过一种类似 NLP 的算法逻辑，将含有噪声的电信号转化为碱基识别的序列数据。

这种方法比起传统的基因测序方法，比如 NGS 来说，速度要更快，而且对变异结构的检测也更准确。

给电脑插个U 盘就能看

而从牛津大学衍生而出的 Oxford Nanopore 公司，就将上述核心技术打包，塞进了这样一个尺寸 10 厘米的U 盘之中:

这一产品叫做 MinION，使用时需要将自己的体液滴到指定位置。

然后再用一根线将其与电脑连接，再安装产品相应的软件，此外再无需任何设置。

然后，就能在电脑屏幕上看到数据采集，实时分析和运行反馈，本地基本通信和数据流:

根据官方的数据，理论上最大输出速度可达到 420 个碱基 / 秒，而从一个单元格中的样本最多可得到 50GB 的数据，准确率达到 88% 以上。

除了对专业的研究人员售卖以外，官方的简介中也表明，没有大量实验室经验的人群也可使用。

完整的产品包售价 1000 美元，折合人民币约 6370 元。

对于这一产品，有人觉得非常有趣，对于学校或者一些个人开发者来说无疑降低了技术门槛。

也有网友吐槽这只是听起来很酷，毕竟除非测序的对象是一个鸡蛋，否则得到的任何序列都只是你全体 DNA 的一个小子集而已。

最近，还有一位来自霍普金斯大学的教授基于这一产品做了进一步的开发，提出了一个叫做 UNCALLED 的程序。

在面对大型序列时，这一软件将序列内容与已知的基因序列进行匹配，快速挑选出所需的目标序列。

举个例子，研究人员想要确定一个人是否携带了遗传性癌症相关基因的变异，就可以使用这一软件快速判断当前样本是否值得研究。

论文:

开源下载:

参考链接:

。

郑重声明：此文内容为本网站转载企业宣传资讯，目的在于传播更多信息，与本站立场无关。仅供读者参考，并请自行核实相关内容。